Menjadi fakultas yang unggul dan inovatif serta pelopor pengembangan sains dan teknologi di tingkat internasional berdasarkan moral agama.
Berdasar pada visi di atas, FST menetapkan misi sebagai berikut:
Penyelenggaraan program pendidikan di FST Universitas Airlangga bertujuan menghasilkan sarjana, magister dan doktor yang berjiwa Pancasila, bermoral agama dan ahli dalam bidang pengetahuan, serta memiliki kualifikasi dan kompetensi sebagai berikut:
“From Fundamental and Applied Science to Sustainable Development”